传统手术(瘘管切开术、肛瘘切除术和挂线疗法)：传统手术常被人们称为“人间炼狱”，可见其痛苦异常，另外传统手术的治疗的时间长，出血多，创伤大，且术后恢复时间超长，一般需要一个月左右的时间住院观察调养，还伴有肛门失禁、肛门狭窄等后遗症和并发症。
　　微创术可以说是传统手术的升级版，排除了传统手术的缺点，其治疗时间短、痛苦少、创伤小、出血少、术后恢复快、无后遗症和并发症，是大多数肛肠疾病患者的追求。

　　治疗肛瘘，关键就在于寻找内口，内口倘有遗漏，肛瘘必然治疗不彻底。东大医生采用卫生部重点推荐的HCPT微创疗法，利用直肠纤维镜进入到肛门里面，借助先进的探针配合双氧水灌注的方法，准确找到全部内口。
　　通过监视器，直接对内口进行微创电凝，使肛瘘的内口干结闭合，然后洗干净瘘管里面的脓液，这样大便后，粪便里面的细菌和粪水无法进入周围的组织，由此阻断感染源头及痛感，使之痊愈。在治疗肛瘘的同时，不损伤肛门功能，将手术创口至少缩小了三分之二，较大程度减少了对机体的损害。

　　随着医学的发展，治疗肛瘘又推出了一种更精细的治疗方法——STARR微创术，它是利用弧形吻合装置，科学放置弧形切除器，前后配置3层纵横交叉钛钉，吻合严密牢固，对瘘管和多余组织进行选择性切除，不破坏肛垫正常生理功能，避免术后肛管直肠狭窄。 　　STARR微创术尤其适用于合并了痔疮的复杂性肛瘘，能准确找到所有内口，无遗漏，从根源治疗，大大减少了手术创伤，并保护肛垫，不留后遗症。